陶士珩
陶士珩
1.基本信息
陶士珩,男,1961年生,安徽歙县人。西北农林科技大学二级教授,博士生导师。1982年本科毕业于南京气象学院农业气象专业;1985年硕士研究生毕业于西南农业大学农业气候专业,同年分配到西北农业大学,从事农业气象学教学与科研;1996年7月晋升副教授;1998年7月获西北农业大学农学博士学位。1999年6月至2001年5月在复旦大学遗传学研究所做群体与数量遗传学博士后研究。2001年12月晋升教授。2007年1月至2008年1月赴美国亚利桑那大学进化与生态学系做访问学者研究。现任教于西北农林科技大学英国正版365官方网站生物信息学教研组,西北农林科技大学生物信息学研究中心主任。
2.研究方向
基因组序列分析与信息挖掘、 分子进化与系统发育。
3.开设课程
先后承担本科生《生物信息学》、《进化生物学》,硕士研究生《高级生物信息学》、《分子进化》、博士研究生《生物信息学研究进展》等课程的教学。
目前已培养硕士研究生50余名,博士研究生10余名;在读硕士研究生6名,博士研究生5名。
4.学术成果
近年来致力于生物信息学、分子进化、群体遗传学等领域的教学与科研工作。目前主要研究方向为:1) 基因组序列分析与信息挖掘,2)分子进化与系统发育; 目前主要从事mRNA二级结构动态变化规律及其对蛋白质翻译调控、微生物组学与表型关系、基因水平转移规律、病毒基因组与寄主基因组协同进化等方向的理论与计算机模拟实验研究。曾获省部级科技进步二等奖(第三名)一项,国家科技进步二等奖(集体奖)一项。主持国家自然科学基金1项,参与“973”项目和“863”项目各1项。
附:近年来发表的主要论著
1. Wu WW, Huang XT, Cheng J, Li ZG, de Folter S, Huang ZR, Jiang XQ, Pang HX and Tao SH*. 2011. Conservation and evolution in and among SRF-and MEF2-type MADS domains and their binding sites. Molecular Biology and Evolution, 28: 501-511. (SCI, IF="9.872)
2. Jiang XQ, Xu Z, Li J, Shi YY, Wu WW and Tao SH*. 2011. The influence of deleterious mutations on adaptation in a sexual population. PLoS one, 6:e27757. (SCI, IF="4.411)"
3. Li L, Guo Y, Wu WW, Shi YY, Cheng J and Tao SH*. 2012. A comparison and evaluation of five biclustering algorithms by quantifying goodness of biclusters for gene expression data. BioData Mining, 5(1): 1-10. (SCI, IF="2.624))
4. Cheng J, Wu WW, Zhang YW, Li XC, Jiang XQ, Wei GH and Tao SH*. 2013. A new computational strategy for predicting essential genes. BMC Genomics, 14:910. (SCI, IF="4.397)
5. Jiang XQ, Hu SJ, Xu Q, Chang YJ and Tao SH*. 2013. Relative effects of segregation and recombination on the evolution of sex in finite diploid populations. Heredity, 111(6):505-512. (SCI, IF="4.110)"
6. Mao YH, Wang WT, Cheng N, Li Q and Tao SH*. 2013. Universally increased mRNA stability downstream of the translation initiation site in eukaryotes and prokaryotes. Gene, 517:230-235. (SCI, IF="2.196)
7. Mao YH, Li Q, Wang WT, Liang PQ and Tao SH*. 2013. Number variation of high stability regions is correlated with gene functions. Genome Biology Evolution, 5:484-493. (SCI, IF="4.759)
8.Mao YH, Liu HL, Liu YL and Tao SH*. 2014. Deciphering the rules by which dynamics of mRNA secondary structure affect translation efficiency in Saccharomyces cerevisiae. Nucleic Acids Research, 42:4813-4822. (SCI, IF="8.808
9.Chang YJ, Hua Y, Jiang XQ and Tao SH*. 2015. Influences of dominance and evolution of sex in finite diploid populations. PloS one, 10(5): e0128459. (SCI, IF="3.534)
10. Meng XW, Wang C, Rahman SR, Wang YX, Wang AL and Tao SH*. 2015. Genome-wide identification and evolution of HECT genes in soybean. International Journal of Molecular Sciences, 16(4):8517-8535. (SCI, IF="2.862)
5.联系方式
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